Es el segundo de los tres videojuegos de la saga 'El Profesor Layton'. De la misma manera que la anterior versión, el juego ha sido desarrollado por Level-5 para Nintendo DS. Llegó al mercado el 29 de noviembre de 2007 en Japón y salió a la venta en España el 25 de septiembre de 2009.

El profesor Layton y la Caja de Pandora.

En esta historia el Profesor y Luke tienen que desvelar el secreto de la caja de Pandora o también conocida como la caja Elísea por los mitos que la envuelven.
Nuestros protagonistas deciden visitar al maestro del Profesor Layton, pero se encuentran con que éste ha muerto en extrañas circunstancias que rodean a la caja como principal sospechoso.

Luke y Layton deciden viajar a bordo del Molentary Express, un tren que esconde un secreto.

El Profesor y Layton se verán involucrados en una serie de misterios que deberán revelar si quieren conocer el misterio de la caja Elísea, que esconde mucho más de lo que la mayoría de la gente cree.

Más de 150 nuevos puzles en esta nueva aventura. Misterio, aventura, amor... todo esto en la nueva aventura del Profesor.

¿Serás capaz de resolver el misterio de la caja?